Certains pôles ont amorcé des collaborations, soit avec des pôles intervenant sur les mêmes thématiques, soit avec des pôles ayant des problématiques complémentaires.
Ces collaborations prennent différentes formes:
- L'élaboration et la mise en oeuvre de chartes de coopération
- La mise en place de comité de coordination
- L'échange sur les stratégies des pôles
- L'échange sur les bonnes pratiques
- La co-labellisation de projets
- La réalisation d'actions communes: on pense par exemple à la participation à des événements communs (salons, conférences...), notamment à l'étranger. Ou à l'établissement commun de cartographie des compétences, des champs d'innovation. Ou encore la mise en commun de moyens mutualisés par exemple sur la veille ou les outils de communication.
Nous avons repéré plusieurs exemples de ces collaborations. Certaines ont été prévues dès la création des pôles : pôles Mer et pôles Aéronautiques. Ces collaborations répondaient aussi aux exigences des financeurs qui souhaitaient une bonne coordination sur ces thématiques pour éviter les redondances.
Les pôles Mer (Bretagne et PACA) ont prévu dès leur origine une démarche de coopération. Un comité de pilotage et de coordination interrégional a été mis en place, constitué des deux bureaux et qui se réunit deux fois par mois. Il est présidé en alternance annuelle par le président de chaque pôle. Sa mission principale est de définir la stratégie et les actions communes aux deux pôles et d'éviter la redondance des investissements entre les deux pôles pour aboutir à des projets indépendants ou coordonnés ou complémentaires.
Plus récemment, les 3 pôles aéronautiques, situés en Aquitaine et Midi-Pyrénées, Ile-de-France et Provence-Alpes-Côte d'Azur, ont signé en septembre 2007, un accord de coopération.
Les 4 pôles automobiles (Mov'eo, MTA, Véhicule du Futur et Automobile Haut de Gamme) ont signé en février 2007 une charte de coopération pour permettre la constitution d''une masse critique visible à l'international. En santé et biotechnologies, les pôles ont pu se regrouper et participer en commun à plusieurs événements internationaux et ont répondu en commun à un appel à propositions de la DGE "Partenariat technologique international des PME des pôles de compétitivité ; s'associer pour gagner en compétitivité". Le but de cet appel à propositions est de favoriser à la fois la participation des PME aux programmes européens et la coopération technologique bilatérale avec des partenaires hors de l'Europe. Cet appel à propositions de la DGE présente la particularité d'être ouvert à des gouvernances de pôles de compétitivité. 2,35 millions d'euros ont été alloués pour le financement le 14 projets retenus.
De même, les Pôles normands ont signé le 20 septembre une charte de collaboration visant à organiser les synergies entre pôles. Les pôles Mov'éo, Transaction électroniques sécurisées, Filière équine et Logistique Seine Normandie partagent les mêmes objectifs de renforcement de leurs efforts en matière de recherche et d'innovation et de conforter le développement économique et la promotion du territoire normand.
Le 25 octobre 2007 a eu lieu la journée d'échanges entre les pôles santé - biotechnologies, à l'invitation de la DGE. Les huit pôles santé - biotechnologies Medicen, LyonbioPôle, Innovations Thérapeutiques Alsace, Cancer Bio-Santé, Prod'Innov, Orphème, Nutrition Santé Longévité et Atlantic Biothérapies ont participé aux discussions.
Dans le domaine des énergies renouvelables, les quatre pôles (Capenergies, DERBI, S2E2, et Tenerrdis) ont signé une charte de coopération à l'occasion de la troisième conférence internationale du pôle DERBI, en juin 2008 à Perpignan. Celle-ci prévoit une coordination sectorielle, des procédures de co- labellisation, des actions communes de communication et un suivi commun des projets des trois pôles. De plus, trois de ces quatre pôles (Capenergies, DERBI et Tenerrdis) sont membres du cluster européen Eurogia dédié aux énergies propres, qui inclut également des partenaires de l'Espagne, des Pays-Bas et de la Norvège.
Le 3 juillet 2008, à l'occasion d'un séminaire entre les pôles Materalia (matériaux innovants pour produits intelligents) et Véhicule du Futur, a été amorcée une coopération entre ces deux pôles qui prendra la forme de colabellisation de projets communs.

